熒光顯微鏡技術(shù)的基本原理是利用熒光劑使細(xì)胞成分具有高度具體的視覺效果,如在目的蛋白后面連接一個(gè)通用的熒光蛋白-GFP。在組織樣本中,如果目的基因不能克隆,則需要使用其他技術(shù)手段來觀察目的蛋白,如免疫熒光染色。為此,抗體需要連接各種不同的熒光染料,并直接或間接地與相應(yīng)的靶結(jié)構(gòu)結(jié)合。此外,在熒光染料的幫助下,熒光顯微鏡技術(shù)不僅局限于蛋白質(zhì),還可以染色核酸、聚糖等結(jié)構(gòu),即使是鈣離子和其他非生物質(zhì)。本文詳細(xì)介紹了幾種常用的熒光劑。
免疫熒光(IF)
在熒光顯微鏡技術(shù)中,你可以通過兩種方式觀察到你的目的蛋白:使用內(nèi)源熒光信號(hào),即通過克隆將熒光蛋白與目的蛋白連接起來;或者將熒光標(biāo)記的抗體特異性與目的蛋白結(jié)合起來。**種方法對(duì)一些生物學(xué)問題更有用或更必要。例如,熒光蛋白不能用于組織樣品,因?yàn)橐话銇碚f,標(biāo)本是從不能保存熒光蛋白的生物體中獲得的。此外,當(dāng)有功能抗體可用時(shí),免疫熒光法比熒光蛋白技術(shù)快得多,因?yàn)楹笳弑仨毾瓤寺∧康幕颍缓髮NA轉(zhuǎn)移到適當(dāng)?shù)募?xì)胞中。熒光蛋白的另一個(gè)缺點(diǎn)是它本身屬于蛋白質(zhì)。因此,這些熒光蛋白在細(xì)胞中具有特定的蛋白質(zhì)特性,會(huì)導(dǎo)致附著的目的蛋白質(zhì)功能障礙或誤解。然而,熒光蛋白技術(shù)仍然是觀察活細(xì)胞的**方法。
免疫熒光法利用抗體與相應(yīng)抗原特異性相結(jié)合的特性,有兩種不同的表現(xiàn)形式。最簡單的方法是使用熒光標(biāo)記抗體,它可以與目的蛋白結(jié)合。這種方法被稱為直接免疫熒光法。
在許多情況下,我們可以使用兩種不同特性的抗體。**種抗體可以與目的蛋白結(jié)合,但它本身沒有熒光標(biāo)記(**種抗性)。**種抗體本身攜帶熒光染料(**種抗性),并可以與**種抗性結(jié)合。這種方法被稱為間接免疫熒光法。這種方法有許多優(yōu)點(diǎn)。一方面,它會(huì)產(chǎn)生放大效應(yīng),因?yàn)椴恢挂环N二次抗性可以與一種抗性相結(jié)合。另一方面,沒有必要始終用熒光染料標(biāo)記目的蛋白,但市場上可以使用熒光標(biāo)記的二次抗性。免疫熒光中廣泛使用的熒光染料包括FITC、TRITC或一些Alexaflur染料,如下所述。
FITC和TRITC
異硫氰酸熒光素(FITC)是一種有機(jī)熒光染料。目前,該熒光染料仍用于免疫熒光和流細(xì)胞手術(shù)。在495/517nm處,該染料會(huì)產(chǎn)生刺激/發(fā)射峰值,并可與異硫氰酸鹽反應(yīng)基團(tuán)與不同抗體結(jié)合。該基團(tuán)可與蛋白質(zhì)上的氨基、硫基、咪唑、酪氨酰、堿基等基團(tuán)結(jié)合。其基本成分-熒光素,摩爾質(zhì)量為332g/mol,常用作熒光示蹤劑。FITC(389g/mol)是熒光顯微鏡技術(shù)中首批用于熒光顯微鏡技術(shù)的染料,被視為后續(xù)熒光染料的起點(diǎn),如Alexaflur488。該染料的熒光活性取決于其大共軛芳香電子系統(tǒng),受藍(lán)光譜中光的刺激。
另一種經(jīng)常與FITC同時(shí)使用的染料是TRITC[四甲基羅丹明-5(6)-異硫氰酸]。與FITC相反,TRITC不是熒光素,而是羅丹明家族的衍生物。羅丹明還擁有一個(gè)大型共軛芳香電子系統(tǒng),這導(dǎo)致了它們的熒光行為。另一點(diǎn)是,與FITC相反,TRITC(479g/mol)受綠色光譜中**波長為550nm的光的刺激,其**發(fā)射波長為573nm。它還基于異硫氰酸鹽反應(yīng)基團(tuán)與蛋白質(zhì)(如抗體)結(jié)合。
雖然FITC和TRITC仍在使用中,但由于它們**的顯微鏡技術(shù),因?yàn)樗鼈儗儆诎l(fā)光相對(duì)較弱的熒光染料,其優(yōu)點(diǎn)只是經(jīng)濟(jì)實(shí)惠。
圖1:果蠅胚胎發(fā)育,綠色:FITC;紅色:TRITC。
青色素
這種熒光染料相對(duì)較少,來自青色素,這也是它名字的起源:Cy2。Cy3。Cy5和Cy7。所有上述青色素都可以通過其反應(yīng)基與核酸或蛋白質(zhì)連接。例如,馬來酰亞胺基團(tuán)用蛋白質(zhì)標(biāo)記。有趣的是,Cy5對(duì)周圍的電子環(huán)境非常敏感,可用于酶測量。附著蛋白質(zhì)的構(gòu)象變化會(huì)導(dǎo)致熒光發(fā)射陽性或陰性變化。此外,Cy3和Cy5也可用于FRET試驗(yàn)。青色素染料是一種相對(duì)較老的熒光染料,但它是其他熒光染料提高亮度、耐光性和量子產(chǎn)率的基礎(chǔ)。
AlexaFluor染料。
Alexaflur染料是一種帶負(fù)電荷和親水性的熒光染料系列。該系列染料范圍廣泛,常用于熒光顯微鏡技術(shù)。這些染料的名稱是由其**者Richardpaulhaugland以其兒子Alexhaugland的名稱命名的。產(chǎn)品標(biāo)識(shí)為Molecularprobes(美國生命科學(xué)技術(shù)公司Lifetechnologies的子公司。注:2014年2月,Lifetechnogies被Thermofisher收購)商標(biāo)。此外,這些產(chǎn)品標(biāo)識(shí)還涵蓋了相應(yīng)的激光刺激波長。比如Alexaflur488,應(yīng)用范圍廣,**刺激波長為493nm,可由標(biāo)準(zhǔn)488nm激光刺激。Alexaflur48的**波長是59。488類似于FITC的屬性。雖然AlexaFlur488是熒光素衍生物,但與FITC相比,它具有更好的穩(wěn)定性和熒光亮度,pH敏感性較低。所有AlexaFlur染料(如AlexaFlur546.AlexaFlur633)都是不同基礎(chǔ)熒光物質(zhì)的磺化形式,如熒光素.香豆素.青色素或羅丹明。
圖2:小鼠轉(zhuǎn)基因胚胎.肢間體節(jié),E10.5小鼠轉(zhuǎn)基因胚胎的五個(gè)肢間體節(jié):EpaxialMyf5egFP;GFP-Alexa488免疫組化染色;用Desmin-Cy3染色胚胎肌纖維,用Hoechstsize自上而下揭示細(xì)胞核:3.5mm(a),800μm(b)。圖片來源:AurelieJory,CellulessouchesesesesesesesesesegBMC,IGBMC。
圖3:小鼠變成纖維細(xì)胞,綠色:F-Actin,F(xiàn)ITC;紅色:Tubulin,Cy5;藍(lán)色:細(xì)胞核,DAPI。圖片來源:德國·海德爾堡·馬克斯·普朗克研究所·GunterGiese博士。
DNA染色
在熒光顯微鏡技術(shù)中,不僅研究蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),而且核酸也具有重要的研究意義。有時(shí),細(xì)胞的準(zhǔn)確位置和數(shù)量必須通過檢測細(xì)胞核來確定。最常用的DNA染色劑之一是DAPI(4、6-2-2-2-苯基消炎),它可以與DNA雙螺旋A-T富集區(qū)結(jié)合。如果DAPI附著在DNA上,其熒光強(qiáng)度將高于自由狀態(tài)。染色劑受**波長為358nm的紫外線刺激,其發(fā)射光譜非常寬,達(dá)到461nm的峰值。此外,弱熒光的RNA結(jié)合也可以檢測到。在這種情況下,發(fā)射波長將轉(zhuǎn)移到500nm。有趣的是,DAPI可以穿透整個(gè)細(xì)胞膜。因此,它可以用于固定和活細(xì)胞。
**種廣泛使用的DNA染色劑是Hoechst染料系列,它們最初是由Hoechstag化學(xué)公司生產(chǎn)的。Hoechst33258.Hoechst3342和Hoechst34580均為雙苯酰亞胺,可嵌入A-T富集區(qū),因此該系列染料很少使用。與DAPI類似,這三種染色劑都能受到**發(fā)射波長為455nm的紫外線刺激,而未結(jié)合的染色劑**發(fā)射波長在510-540nm之間。Hoechst染色劑也具有細(xì)胞滲透性,因此可用于活細(xì)胞或固定細(xì)胞。染色劑和DAPI的區(qū)別在于毒性低。
碘化丙啶(Propidium-Iodide,PI)是一種不能通過細(xì)胞膜的DNA染色劑。由于上述特性,染色劑不能進(jìn)入完整的細(xì)胞,因此染色劑通常用于區(qū)分細(xì)胞組中的活細(xì)胞和死細(xì)胞。此外,碘化丙啶也是一種嵌入劑,但對(duì)于不同的堿基沒有結(jié)合差異。染色劑與核酸結(jié)合后,**刺激波長為538nm,**發(fā)射波長為617nm。未結(jié)合PI的**刺激和發(fā)射波長和光強(qiáng)較低。PI也可以與RNA結(jié)合,無需改變其熒光特性。有時(shí),為了區(qū)分DNA和RNA,有必要使用適當(dāng)?shù)暮怂崦浮?/p>
無需早期處理,就可以識(shí)別DNA和RNA。與DNA結(jié)合后,**刺激/發(fā)射波長為502nm/525nm,而與RNA結(jié)合后,**刺激/發(fā)射波長為460nm/650nm。此外,它還可以進(jìn)入溶酶體和其他酸性區(qū)域。在這里,陽離子染料被質(zhì)子化。在這種酸性環(huán)境下,由藍(lán)色光譜中的光刺激,但發(fā)射波長在橙色區(qū)域**。由于凋亡細(xì)胞有大量被吞噬的酸性區(qū)域,因此常用作這些細(xì)胞的標(biāo)記物。
區(qū)室和細(xì)胞器特異性染料。
在熒光顯微鏡技術(shù)中,溶酶體、核內(nèi)體等細(xì)胞室和線粒體等細(xì)胞器經(jīng)常被染色。為此,本部分介紹了一系列可供選擇的特異性染料。
觀察線粒體最常用的方法是使用Mitotracker,它是一種可以通過細(xì)胞的染料,包括輕度硫基化的氯甲基活性部分。正因?yàn)槿绱耍梢耘c半胱氨酸殘留物的游離硫醇基發(fā)生反應(yīng),從而與基質(zhì)蛋白結(jié)合。Mitotracker有不同的顏色和裝飾類型(見表1),此外,它也是Molecularprobes的商標(biāo)。與羅丹明123(Rh123)或tetramethrosamine等常規(guī)線粒體特異性染色劑不同,Mitotracker在用固定劑破壞膜電位后不會(huì)被洗掉。
根據(jù)線粒體染色劑,一些染料可以標(biāo)記溶酶體和其他酸性區(qū)域,這被稱為Lysotracker。它們由連接熒光基團(tuán)的弱堿基團(tuán)組成,具有膜穿透性。最有可能的情況是,這些堿基因的質(zhì)子化對(duì)酸性區(qū)域有親和力。Lysotracker有多種不同的顏色可供選擇(見表1)。
類似溶酶體的房間是真菌中的液泡,如釀酒酵母,這也是一個(gè)酸性環(huán)境。如果您想在熒光顯微鏡下觀察上述房間,請(qǐng)使用FM4-64或FM5-95等苯乙烯基染料。
內(nèi)質(zhì)網(wǎng)(ER)對(duì)蛋白質(zhì)分泌實(shí)驗(yàn)具有重要的研究意義。染色上述區(qū)間的**染料是DiOC6(3)。雖然染料更喜歡ER,但它仍然與線粒體和其他細(xì)胞器膜結(jié)合。ER特異性染色的另一種方法是使用ER-Trackergren和Red等ER-Tracker,而ER-Trackergren和Red是基于BODIPY的兩種染料,它們與格列本脲(一種磺酰脲酶)相連,可以與僅存在于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上的ATP敏感鉀通道相結(jié)合。BODIPY(硼-二吡咯亞甲基,boron-diPyromethene)是一種幾乎不溶于水的染料基團(tuán),對(duì)pH相對(duì)不敏感。這種染料對(duì)蛋白質(zhì)標(biāo)記用處不大,但卻是脂質(zhì)和膜標(biāo)記的好工具。
對(duì)于與ER相鄰的高爾基體,可以用NBDC6-ceramide、BODIPYFLC5-ceramide等熒光神經(jīng)酰胺類似物進(jìn)行標(biāo)記。上述神經(jīng)酰胺是鞘脂,在高爾基體中高度富集。
在基于脂質(zhì)的染料的幫助下,可以對(duì)脂筏等特定膜區(qū)域進(jìn)行染色。使用NBD-6Cholestrol或NBP-12Cholestrol可以觀察膽固醇富集區(qū)(AvantiPolarlipids)。
除了使用特異性非蛋白熒光染料來標(biāo)記細(xì)胞區(qū)域外,還可以使用對(duì)細(xì)胞中不同位置有偏好的蛋白質(zhì)來染色目標(biāo)區(qū)域。這些蛋白質(zhì)可以與熒光染料連接,并可以通過熒光顯微鏡觀察到。使用這種方法的一個(gè)例子是麥胚凝集素(WGA)可以與細(xì)胞質(zhì)膜中的唾液酸和N-乙酰葡萄糖胺基特異性結(jié)合,將WGA與熒光染料連接起來,這樣我們就可以觀察到細(xì)胞質(zhì)膜。
圖4:Pukinje細(xì)胞,小鼠小腦皮質(zhì)三重標(biāo)記的縱側(cè)截面圖。紅色:Anti-calbindin-D28k/Cy3;綠色:Anti-GFAP/Cy5;藍(lán)色:Hoechst3258。
圖5:牛肺內(nèi)皮細(xì)胞。紅色:用MitotrackerRedCMXRos標(biāo)記的線粒體;綠色:用綠色熒光BODIPYFLPhallacidin標(biāo)記的纖維狀肌動(dòng)蛋白;藍(lán)色:用DAPI標(biāo)記的細(xì)胞核。使用三維盲反褶積可以提高圖像質(zhì)量。
離子成像
在對(duì)神經(jīng)元的研究中,觀察基因活性或細(xì)胞運(yùn)動(dòng)對(duì)了解細(xì)胞的離子濃度具有重要意義。鈉、鈣、氯或鎂離子對(duì)許多不同的細(xì)胞活性有很大的影響。一般來說,用熒光標(biāo)記的螯合劑可以困住離子,螯合劑結(jié)合相應(yīng)的離子后會(huì)改變離子的光譜特性。例如,利用這一原理的鈣指示劑fura-2.indo-1.fluo-3.fluo-4和calcium-gren。
對(duì)于鈉離子的檢測,通常使用SBFI(sodium-bindingbofurzanisophthalate)或Sodiumgren。
有趣的是,還有基于蛋白質(zhì)的鈣指示劑,其中一種是基于水母化學(xué)發(fā)光蛋白的水母素。水母素。發(fā)光體腔腸素。分子氧和Ca2+的相互作用會(huì)釋放藍(lán)光,這是熒光蛋白發(fā)現(xiàn)過程中非常有名的機(jī)制。