BODIPY 558/568 COOH 是一種基于 BODIPY（boron-dipyrromethene，硼二吡咯亞甲基）結構的紅橙色熒光染料，具有良好的光學性質、高光穩定性和優異的化學修飾能力。

它的結構中引入了一個羧基（–COOH）官能團，使其能通過酰胺鍵偶聯到蛋白質、肽、寡核苷酸或其他含氨基的分子上，廣泛應用于生物成像、熒光標記、分子探針和熒光共振能量轉移（FRET）研究。

常用名 BDP 558/568-羧酸

英文名 BDP 558/568 carboxylic acid

CAS號 150173-72-1

分子量 346.16

分子式 C16H13BF2N2O2S

1. 蛋白質和多肽標記

通過EDC/NHS化學或活化酰胺偶聯反應，將BODIPY 558/568 COOH與蛋白質上的氨基殘基（如賴氨酸）偶聯，形成穩定的酰胺鍵，實現熒光標記。適用于Western blot、免疫組化、ELISA、細胞內追蹤等。

2. 寡核苷酸與核酸探針

通過在寡核苷酸末端修飾氨基（–NH?），可與BODIPY 558/568 COOH偶聯，構建熒光探針，用于FISH、qPCR、miRNA檢測等。

3. 細胞與亞細胞成像

BODIPY染料因其疏水性，可在親脂結構（如膜、脂滴、線粒體）中積累。羧基修飾版本可用于構建靶向性探針，對特定細胞器成像提供工具。

4. FRET研究

由于其激發和發射光譜與某些供體染料（如Cy3、Alexa 546）配對良好，常用作FRET的能量受體，用于研究蛋白相互作用、酶活性變化等。

5. 流式細胞術

標記抗體后可用于多色流式分析，尤其在紅色通道（如PE、PerCP）被占用時作為替代紅橙色染料使用，信噪比良好，背景低。

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