6-FAM SE,92557-81-8,熒光素NHS活性酯類染料的結(jié)構(gòu)合成
6-FAM SE(6-Carboxyfluorescein N-succinimidyl ester)是熒光素(fluorescein)衍生的NHS活性酯類染料,其結(jié)構(gòu)由熒光素分子主架與一個活化羧酸(羧基活性酯)相連,賦予其與氨基分子共價結(jié)合的能力。該染料用于核酸測序、寡核苷酸標(biāo)記、蛋白質(zhì)修飾及實時熒光PCR探針制備等領(lǐng)域。
其結(jié)構(gòu)合成路線通常以6-羧基熒光素(6-FAM)為起點。首先在無水有機溶劑如DMF或DCM中,將6-FAM的羧基與N,N’-二環(huán)己基碳二亞胺(DCC)或EDC活化,再引入N-羥基琥珀酰亞胺(NHS),生成具有反應(yīng)活性的6-FAM-NHS酯,即6-FAM SE。該反應(yīng)通常在惰性氣氛(氮氣或氬氣)中進(jìn)行,以避免水分導(dǎo)致的水解,并可加入催化劑如DMAP促進(jìn)反應(yīng)進(jìn)行。
終產(chǎn)物為穩(wěn)定的粉末狀橙黃色染料,其SE(NHS酯)基團(tuán)在中性或堿性條件下(pH 7.5–8.5)可高效與伯胺反應(yīng)形成酰胺鍵。這使其特別適合于寡核苷酸5'端標(biāo)記、氨基修飾引物的熒光接枝及核苷酸衍生物合成。由于FAM熒光信號強烈、量子產(chǎn)率高且發(fā)射波長(約520 nm)與常用激光器兼容,因此是Illumina、ABI等測序平臺中的標(biāo)準(zhǔn)標(biāo)記染料。
結(jié)構(gòu)上,6-FAM SE具有剛性平面三環(huán)共軛系統(tǒng),使其熒光性能在共價偶聯(lián)后仍保持穩(wěn)定。在合成后的純化過程中,常采用反相HPLC進(jìn)行色譜分離,并通過MS與NMR確認(rèn)其分子結(jié)構(gòu)。其優(yōu)異的化學(xué)穩(wěn)定性與易于偶聯(lián)特性,使其成為現(xiàn)代分子生物學(xué)中不可或缺的熒光構(gòu)建模塊之一。
英文名稱: 6-FAM, SE
中文名稱: 6-羧基熒光素琥珀酰亞胺醚
MF: C25H15NO9
MW: 473.39
CAS: 92557-81-8
純度:95%+
性狀:基于不同的分子量,呈白色 / 類白色固體,或液體。
溶劑:溶于二氯甲烷、DMSO、水等常規(guī)有機溶劑。
儲藏條件:-20°C干燥避光保存
包裝規(guī)格:50mg 100mg 250mg 500mg(按需提供)
齊岳生物供應(yīng)近紅外熒光花菁染料標(biāo)記各種官能團(tuán)的定制服務(wù),如活性酯(NHS酯)、馬來酰亞胺(MAL)、疊氮(N?)、炔基(alkyne)等,便于與蛋白質(zhì)、肽、多糖、抗體、寡核苷酸、納米顆粒等共價偶聯(lián)。
推薦產(chǎn)品:
TQ7.2WS NHS
Tide Quencher 7.2WS SE
Tm-DOTMA
2126179-30-2
含有銩金屬離子的大環(huán)多胺配合物
Tide Quencher8WS acid
僅供科研,不能用于人體實驗AXC.2025.06.23