Cy5 phosphoramidite,CY5亞磷酰胺的反應(yīng)機(jī)理
產(chǎn)品名稱:Cy5 phosphoramidite,CY5亞磷酰胺
純度:95%+
Cy5 phosphoramidite是一種功能性核酸修飾試劑,其結(jié)構(gòu)中引入了Cyanine5熒光基團(tuán)與亞磷酰胺鍵結(jié)構(gòu),使其可在自動化固相DNA/RNA合成中用作3’或5’末端標(biāo)記的熒光單體。該化合物設(shè)計(jì)用于兼容標(biāo)準(zhǔn)磷酸三酯化學(xué),在寡核苷酸鏈合成的后一步(通常在5’端)引入,通過標(biāo)準(zhǔn)的固相合成儀器與反應(yīng)程序即可完成標(biāo)記。反應(yīng)機(jī)理基于亞磷酰胺基團(tuán)在酸催化劑(如tetrazole或其衍生物)存在下被活化,與合成中的寡核苷酸的5’-羥基發(fā)生親核取代反應(yīng),形成磷酸三酯鍵。隨后通過氧化步驟(常用碘/吡啶/水溶液體系)將不穩(wěn)定的三價(jià)磷中間體轉(zhuǎn)化為穩(wěn)定的五價(jià)磷酸酯結(jié)構(gòu)。Cy5本身的疏水結(jié)構(gòu)要求合成中選用適度性有機(jī)溶劑(如干燥的CH?CN)以保證反應(yīng)效率。標(biāo)記后的寡核苷酸在脫保護(hù)與純化(如HPLC或PAGE)后仍保留其Cy5熒光特性,可用于實(shí)時(shí)PCR、原位雜交(FISH)、核酸探針追蹤等多種生物技術(shù)應(yīng)用。由于Cy5在近紅外區(qū)有良好信噪比,尤其適用于熒光成像和微陣列分析。此外,Cy5-phosphoramidite還可設(shè)計(jì)為含有碳鏈間隔臂,提高其在雜交狀態(tài)下的熒光穩(wěn)定性與生物相容性。整體而言,該試劑結(jié)合了Cy5的優(yōu)異熒光性能與亞磷酰胺的高偶聯(lián)效率,是熒光核酸標(biāo)記領(lǐng)域不可或缺的工具。
性狀:基于不同的分子量,呈白色 / 類白色固體,或液體。
溶劑:溶于二氯甲烷、DMSO、水等常規(guī)有機(jī)溶劑。
儲藏條件:-20°C干燥避光保存
包裝規(guī)格:50mg 100mg 250mg 500mg(按需提供)
齊岳生物供應(yīng)近紅外熒光花菁染料標(biāo)記各種官能團(tuán)的定制服務(wù),如活性酯(NHS酯)、馬來酰亞胺(MAL)、疊氮(N?)、炔基(alkyne)等,便于與蛋白質(zhì)、肽、多糖、抗體、寡核苷酸、納米顆粒等共價(jià)偶聯(lián)。
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