UDP糖|從分子模型的角度研究人類udp -糖基轉(zhuǎn)移酶(UGT)的udp -糖選擇性
人尿苷二磷酸(UDP)-糖基轉(zhuǎn)移酶(UGT)超家族的酶通常催化從UDP-糖輔因子到相對小的親脂化合物的糖的共價加成。
糖偶聯(lián)物的生物活性通常較低,可提高水溶性,有助于更**地從體內(nèi)排出。實驗數(shù)據(jù)表明,UGT蛋白對不同的udp -糖表現(xiàn)出不同的選擇性。
雖然UGT蛋白的三維(3D)結構需要深入了解各種UGT蛋白的udp -糖選擇性,但目前還沒有與udp -糖結合的人類UGT的實驗結構。
因此,三維結構的缺乏為在原子水平上分析udp -糖的選擇性提出了一個主要的挑戰(zhàn)。在這篇評論中,我們著重介紹了比較同源性建模在理解UGT蛋白的udp -糖選擇性方面的應用。
c端(CT)結構域的同源性模型表明UGT家族具有高度保守的結構折疊,與UGT2B7-CT x射線晶體結構相比,其主鏈均方根偏差(rmsds)介于0.066和0.079 ?之間。
該模型表明,CT信號序列末端的四個殘基對udp -糖的選擇性起著重要作用。n端結構域不太可能與udp -糖的選擇性相關,盡管UGT 1和2家族中的保守殘基Arg-259 (UGT2B7編號)可能會影響udp -糖的選擇性。總的來說,在預測影響udp -糖結合選擇性的關鍵殘基方面,該模型與實驗觀察結果非常一致。
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