UDP 糖|抗生素合成UDP-glucuronate 4- epiimerase MoeE5與底物復合物的結構
環孢鏈霉菌(Streptomyces viridosporus)的異丙基酶MoeE5將udp -葡萄糖醛酸(UDP-GlcA)轉化為udp -半乳糖醛酸(UDP-GalA),為合成莫尼霉素(moenomycin)提供了**個糖。
莫尼霉素是一種對細菌肽聚糖糖基轉移酶的****劑。
該酶屬于udp -己糖4-異丙基酶家族,以NAD+作為輔助因子。
本文報道了MoeE5/NAD+/UDP-GlcA和MoeE5/NAD+/UDP-glucose的復雜晶體結構,其分辨率分別為1.48??和1.66??。
輔因子NAD+與n端Rossmann-fold結構域結合,襯底與較小的c端結構域結合。
在這兩種晶體中,底物糖基部分的C4原子靠近NAD+的煙酰胺的C4原子,糖的O4原子也與Tyr154的側鏈氫鍵結合,表明了一種生產結合模式。
作為該蛋白家族中**個在活性位點上與UDP-GlcA結合的復雜結構,它在酶和底物之間顯示出廣泛的氫鍵網絡。
我們進一步用產物UDP-GalA建立模型,發現MoeE5中獨特的Arg192可能在催化過程中發揮重要作用。
因此,MoeE5可能是UDP-GlcA轉化為UDP-GalA的一種特異性異丙基酶,而不是像其他家族成員那樣是一種混雜酶。
UDP-L-RhaNAc | UDP-4n-D-FucNAc |
UDP-D-XylNAc | UDP-VioNAc |
UDP-2-Biotinyl-GalNAc | UDP-6-Biotinyl-GalNAc |
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