Cy5.5-phosphoramidite,CY5.5標記亞磷酰胺的反應步驟
Cy5.5-Phosphoramidite是一種基于近紅外熒光染料Cy5.5的亞磷酰胺衍生物,主要用于核酸合成中引入熒光標簽,便于熒光檢測與分子追蹤。亞磷酰胺化學作為固相寡核苷酸合成的核心步驟,涉及具有高反應活性的亞磷酰胺基團與核苷酸的羥基反應,形成磷酸酯鍵。將Cy5.5染料修飾于亞磷酰胺骨架,可實現熒光功能的核酸合成標記。
反應體系與底物
Cy5.5-Phosphoramidite常用于固相合成系統,其反應對象為游離5'-羥基的核苷酸或修飾核酸。合成一般在惰性氣氛(如氮氣或氬氣)中進行,防止亞磷酰胺基團被水分水解。
反應溶劑與條件
反應多在無水有機溶劑中進行,如無水的二氯甲烷(DCM)、乙腈(ACN)或二甲基甲酰胺(DMF)。保持反應體系極度干燥,避免水分導致的亞磷酰胺水解,降低產率。溫度通常控制在室溫(20–25℃),以保證亞磷酰胺的活性和核苷酸的穩定性。
反應步驟
將Cy5.5-Phosphoramidite與5'-羥基的核苷酸固相支持物接觸,在催化劑(如四乙基胺鹽或二苯基磷酰氯)輔助下,亞磷酰胺基團活化并與羥基發生親核加成反應,生成磷酸三酯鍵。
反應時間一般為1-3分鐘,快速且高效,確保鏈延伸的準確性。
反應完成后,加入氧化劑(如碘溶液)氧化磷酸三酯成更穩定的磷酸酯結構。
反應控制要點
無水環境:反應中任何水分均可導致亞磷酰胺水解,產生副產物,降低合成效率。
催化劑和氧化劑的選擇:保證反應選擇性和產物穩定性,催化劑用量需精確控制。
反應時間與溫度:控制合成周期,避免染料或核酸降解。
純化處理:合成后采用高效液相色譜(HPLC)純化,去除未反應物和副產物。
光學與化學穩定性
產品名稱:Cy5.5-phosphoramidite,CY5.5標記亞磷酰胺
純度:95%+
性狀:固體或液體
儲藏條件:-20°C干燥避光保存
包裝規格:50mg 100mg 250mg 500mg(按需提供)
廠家:齊岳生物
關于我們
齊岳生物供應近紅外熒光花菁染料標記各種官能團的定制服務,如活性酯(NHS酯)、馬來酰亞胺(MAL)、疊氮(N?)、炔基(alkyne)等,便于與蛋白質、肽、多糖、抗體、寡核苷酸、納米顆粒等共價偶聯。可選擇多種功能團與目標分子進行精準結合,實現對蛋白質、多肽、抗體、核酸或納米材料的熒光修飾。此外,齊岳生物還提供定制染料標記服務,包括肽類、蛋白類、小分子、糖類等不同類型標的物,滿足用戶在科研、成像等多方面的個性化應用。
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