Cy3-dCTP,花菁類熒光染料CY3共價連接至脫氧胞苷三磷酸的反應步驟
Cy3-dCTP 是將花菁類熒光染料 CY3 共價連接至脫氧胞苷三磷酸(dCTP)分子上的熒光核苷酸衍生物,應用于分子生物學實驗,如熒光原位雜交(FISH)、熒光PCR、DNA合成標記、測序等。該標記形式通過在堿基或糖環結構上引入熒光團,實現對核酸合成或模板識別過程的可視化分析。
CY3-dCTP 的合成通常采用核苷酸修飾策略,在保持 dCTP 三磷酸骨架完整性的基礎上,引入一個連接基團(如氨基烷基鏈或氨基酯鏈)作為染料偶聯位點。常用的策略是在 dCTP 的 5-位堿基上引入氨基鏈(如 aminoallyl-dCTP),再通過與 CY3-NHS 酯進行后期修飾形成酰胺鍵。
具體反應步驟如下:
合成氨基修飾核苷酸:以脫氧胞苷為起始物,通過在其C5位引入一個氨基烷基側鏈,得到 aminoallyl-dCTP。該中間體既保持核苷酸原有的堿基配對能力,又引入一個活潑伯胺,用于后續標記。
CY3-NHS 酯制備與活化:CY3通過與N-羥基琥珀酰亞胺反應形成NHS活酯,使染料具備與胺反應的能力。該酯在干燥有機溶劑(如DMSO)中配制,以保持其活性。
偶聯反應:將 aminoallyl-dCTP 溶解于碳酸鹽緩沖液(pH 8.5),加入適量 CY3-NHS 酯(通常以1.2–1.5倍摩爾量),在避光條件下溫和反應 2–4 小時,生成穩定的 CY3-dCTP。整個過程需嚴格避免金屬離子污染和強氧化環境,以防止核苷酸降解。
純化過程:反應后使用離子交換色譜或反相HPLC分離純化,去除未反應染料、緩沖鹽及副產物。純品可進一步凍干保存,確保其三磷酸結構穩定。
驗證與儲存:通過質譜、核磁共振(NMR)及紫外-可見光譜(UV-Vis)進行結構鑒定,確認熒光團成功引入。CY3-dCTP 需冷凍避光儲存(-20°C以下),以維持熒光強度及核苷酸穩定性。
該標記核苷酸可被DNA聚合酶識別并摻入新合成的鏈中,保留其熒光性質,適用于高靈敏度的分子追蹤實驗,具有的實驗室應用價值。
產品名稱:Cy3-dCTP,花菁類熒光染料CY3共價連接至脫氧胞苷三磷酸
純度:95%+
性狀:固體或液體
儲藏條件:-20°C干燥避光保存
包裝規格:50mg 100mg 250mg 500mg(按需提供)
廠家:齊岳生物
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齊岳生物供應近紅外熒光花菁染料標記各種官能團的定制服務,如活性酯(NHS酯)、馬來酰亞胺(MAL)、疊氮(N?)、炔基(alkyne)等,便于與蛋白質、肽、多糖、抗體、寡核苷酸、納米顆粒等共價偶聯。可選擇多種功能團與目標分子進行精準結合,實現對蛋白質、多肽、抗體、核酸或納米材料的熒光修飾。此外,齊岳生物還提供定制染料標記服務,包括肽類、蛋白類、小分子、糖類等不同類型標的物,滿足用戶在科研、成像等多方面的個性化應用。
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