5-Vinyl-2′-deoxyuridine (VdU),中文名稱為 5-乙烯基-2′-脫氧尿苷,是一種經常應用于核酸化學、分子生物學和化學生物學研究的重要核苷衍生物。它屬于修飾型脫氧核苷,其分子結構在胸苷(dT)或脫氧尿苷(dU)基礎上,于嘧啶環的 5 位引入了乙烯基基團。
英文名 5-vinyl-2'-deoxyuridine
CAS號 55520-67-7
分子量 254.23900
密度 1.516g/cm3
沸點 N/A
分子式 C11H14N2O5
熔點 N/A
分子結構與化學特征
VdU 的核心骨架仍然是 2′-脫氧核苷,包含嘧啶堿基(尿嘧啶)和 2′-脫氧核糖。其顯著特征是堿基的 C5 位上連接了一個乙烯基基團(-CH=CH?)。這一不飽和基團不僅改變了分子的電子性質,也為后續多種化學修飾或偶聯反應提供了反應位點。
乙烯基基團可以參與多種“點擊化學”反應(例如羥基自由基加成、自由基聚合反應等),這使得 VdU 成為開發功能化核酸探針或生物材料的原料。
應用領域
1. 寡核苷酸合成與探針開發
VdU 是核酸化學領域中備受關注的修飾單體。在固相合成寡核苷酸過程中,VdU 可被引入到特定位點,從而在寡核苷酸鏈上生成具有乙烯基功能基團的位點。這些位點可用于:
后續共價偶聯熒光染料
連接生物探針或配體
與藥物或功能性分子耦合
這樣的設計可制備出多功能核酸探針,用于分子成像、靶標識別以及基因檢測。
2. 生物正交化學(Bioorthogonal Chemistry)
乙烯基基團是一種出色的化學“手柄”,能夠與多種化學試劑進行反應,同時對生物體系具有較低的干擾。在生物正交化學領域,VdU 常用于:
與硫醇、疊氮化合物或其他活性基團反應,進行分子標記
在細胞或體內體系中實現精準的核酸標記
構建多功能納米藥物載體
3. DNA 結構與功能研究
VdU 在研究 DNA 結構和相互作用方面也具有重要價值。其 5-位修飾可:
改變 DNA 雙螺旋的穩定性
改變堿基配對特性
用作研究 DNA-蛋白質相互作用的化學探針
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