GDP-L-fucose-CY5,CY5標記GDP-L-巖藻糖的合成過程研究
GDP-L-fucose-CY5 是將活性糖基化底物 GDP-L-巖藻糖(Guanosine diphosphate-L-fucose)與近紅外熒光染料 CY5 共價連接形成的熒光核苷酸糖探針,應(yīng)用于糖基轉(zhuǎn)移酶底物篩選、糖生物合成研究和細胞糖基化動態(tài)成像等領(lǐng)域。該探針結(jié)構(gòu)特點在于保留了 L-fucose 的糖基結(jié)構(gòu)及 GDP 的識別功能,同時通過 CY5 實現(xiàn)熒光追蹤能力。
合成過程主要包括以下步驟:
功能位點選擇與設(shè)計
GDP-L-fucose 分子含有多個羥基,合成中避免破壞糖苷鍵和磷酸基團活性。常選擇在 GDP 的 2' 或 3'-OH 或 fucose 的羥基通過點擊化學進行間接修飾。一般使用 L-fucose 衍生物(如 amino-fucose)與 CY5-NHS 或 CY5-alkyne 實現(xiàn)標記。
引入功能連接臂
使用帶有疊氮基(azide)的修飾 GDP-L-fucose(例如 azido-propyl-GDP-fucose)作為前體,與含炔基的 CY5(如 CY5-alkyne)進行 CuAAC(銅催化疊氮-炔環(huán)加成)點擊反應(yīng)。此反應(yīng)具有高選擇性和溫和條件,是實現(xiàn)糖探針構(gòu)建的主流方式。
點擊反應(yīng)條件
反應(yīng)體系:GDP-L-fucose-N? + CY5-alkyne + CuSO? + sodium ascorbate;
溶劑體系:DMSO/H?O 或 Tris 緩沖液;
反應(yīng)時間:室溫或37°C,避光反應(yīng)4~16小時。
純化過程
由于產(chǎn)物極性強,常采用陰離子交換色譜(DEAE柱)或反相HPLC進行分離,收集特定熒光峰。純化后可透析去除銅離子殘留,得到穩(wěn)定、可儲存的水溶性產(chǎn)物。
產(chǎn)品名稱:GDP-L-fucose-CY5
純度:95%+
性狀:基于不同的分子量,呈白色 / 類白色固體,或液體。
溶劑:溶于二氯甲烷、DMSO、水等常規(guī)有機溶劑。
儲藏條件:-20°C干燥避光保存
包裝規(guī)格:50mg 100mg 250mg 500mg(按需提供)
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