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熒光素酶催化發光底物-熒光素/腔腸素驗證miRNA 靶基因
發布時間:2021-03-08     作者:zzj   分享到:

熒光素酶(luciferaseLuc)是指能催化不同底物(如熒光素、腔腸素等)發生氧化使其發射出熒光的一類酶的總稱,在許多昆蟲、海洋生物和原核生物中均能分離得到。目前最常用的熒光素酶有細菌熒光素酶(bacterial luciferaseBL)和螢火蟲熒光素酶(firefly luciferaseFL)兩大類。細菌熒光素酶是一種具有熱不穩定性的異源蛋白二聚體,含有α、β 兩個多肽亞基的加單氧酶,它能催化長鏈脂肪醛、還原性黃素(FMNH2)和O2的氧化反應,發出藍綠光(λ=490 nm)。螢火蟲熒光素酶由單一多肽鏈組成,在Mg2+ATPO2 存在時,催化D-熒光素(D-Luciferin)氧化脫羧發光(λ=550~580 nm),FL 的檢測線性范圍寬達78 個數量級,檢測靈敏度可達10-19次方mol(比CAT 100倍),現已成為哺乳細胞中的最常使用的報告基因。高靈敏度、多用途、半衰期短、背景**和相對簡單的分析方法是螢火蟲熒光蛋白流行使用的主要原因。常用的檢測熒光素酶的方法有液閃法和光照度計法。隨著具有膜透過性和光裂解作用的螢火蟲熒光素酶的發現和使用,無需裂解細胞即可檢測酶的活性。

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熒光素酶普遍具有靈敏度高、檢測快速、方便等特點。熒光素酶通過載體構建可以研究基因組織的特異性表達;對一些細胞的生長和轉移等變化進行實時觀測和評估;在驗證miRNA 靶基因中熒光報告載體實驗則是目前的常用方法;有些情況如用逆轉錄酶病毒構建的方法在較長時間的培養中則發現表達熒光素酶的能力下降。熒光素酶能與蛋白產生融合,可以構建雙報告基因的表達系統,如海腎熒光素酶與紅色熒光蛋白、螢火蟲熒光素酶與綠色熒光蛋白以及螢火蟲熒光素酶與海腎熒光素酶等雙表達系統。目前這類報告基因發展迅速、應用領域日趨廣泛。

海腎熒光素酶基因(renilla luciferaseRluc)是一種新型的熒光素酶報告基因,近年來發展迅速。該基因的cDNA 是從海洋中的珊瑚蟲類腔腸動物海腎中克隆而來,然后與pRL 載體相連構建而成。Rluc 表達的蛋白是一種36 kD的單體酶(RLUC),能夠催化可穿透細胞膜的腸腔酶氧化并發出熒光,酶在與其底物相互作用后,隨著螢光素的氧化而發出熒光,并且反應效率很高,幾乎所有輸入反應的能量都被轉化為光。還有研究認為,接觸反應基團與熒光生成的去碳酸基反應直接相關,其他活性產物可用于底物的結合。在活細胞內,Rluc 表達產物還能作為Ca2+的熒光指示劑。

海腎熒光素酶作為一種新型的熒光素酶報告基因,有著更**的優點:(1)低背景,靈敏度高,可檢測10-19次方mol 的海腎熒光素酶,比已發表的方法靈敏度高幾個數量級;(2)線性范圍廣,能得到可靠的、超過7 個數量級酶活力的結果;(3RLUC 的檢測既可用終點法檢測,也可用于非裂解性檢測。

目前已經有**成熟的可同時檢測螢火蟲熒光素酶和海腎熒光素酶的系統,我們通常稱為雙熒光素酶報告系統。

基本原理

由于miRNA主要通過作用于靶基因的3UTR起作用,可以將目的基因3UTR區域構建至報告基因luciferase的后面,通過比較過表達或者干擾miRNA后,報告基因表達的改變(監測熒光素酶的活性變化)可以定量反映miRNA對目的基因的**作用。

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進行驗證實驗之前已經準備好的內容如下:

靶基因的3UTR序列;

研究的miRNAmimics

實驗流程:

需要將靶基因的3UTR構建入pmirGLO載體中,載體圖譜如下:

image.png

該載體包含螢火蟲熒光素酶和海腎熒光素酶雙報告基因,實驗中需要將靶基因的3’UTR 通過該載體的多克隆位點連入螢火蟲熒光素酶報告基因的下游。

獲得靶基因的3UTR可通過PCR獲得,該方法引物設計時候需要在引物上添加相應的與載體合適的酶切位點和保護堿基(以人的GAPDH為例可選擇NheIXbaI兩個酶切位點)。

也可通過化學合成的方法直接合成靶基因的3UTR 并連入pmirGLO載體中,也需要用到相應的酶切位點。構建好的質粒可以命名為WT

WT的基礎上通過點突變或者化學合成的方法構建MUT質粒。

需要根據miRNA的種子區序列將對應種子區序列結合的靶基因3UTR的序列突變,使miRNA不能與MUT質粒上的靶基因的3UTR結合,通常大部分文獻中習慣將結合序列突變為對應的互補序列,例如:原結合序列為ACTAAGG,突變后序列為TGATTCC

構建好WTMUT質粒后進行相應的細胞轉染,細胞的選擇需要根據轉染難易程度、內源性miRNA表達量等因素綜合選擇。


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