一文了解熒光標記肽核酸PNA
一文了解熒光標記肽核酸PNA
肽核酸 (Peptide Nucleic Acid，PNA) 是一種人工合成的類似于 DNA 或 RNA的聚合物。與多肽類似，各種嘌呤和嘧啶堿基通過亞甲基羰基連接到主鏈骨架上。由于PNA不帶負電荷，與DNA和RNA之間不存在靜電斥力，因而結合的穩定性和特異性都大為提高。不易被DNA酶和蛋白酶水解，
熒光標記標記PNA
PNA鏈5’端和3’端均可以標記。由于3' 端是非活性基團(-CONH2)，所以需加入一個賴氨酸，其側鏈上的氨基可以用來標記。
如果在5' 端標記，我們建議在PNA 和標記物之間加 1-2 O linkers。
標記物：熒光基團（—NHS酯或羧基酰胺）、生物素、棕櫚酸、地高辛、DABCYL、疊氮化物、亞甲基藍、巰基等。
<常見的熒光標記>
Dye | Ex (nm) | Em (nm) | Dye | Ex (nm) | Em (nm) |
FAM | 492 | 518 | ATTO425 | 436 | 484 |
FITC | 492 | 518 | AlexaFlour488 | 494 | 517 |
OregoneGreen488 | 498 | 526 | TAMRA | 553 | 576 |
Cy3 | 550 | 570 | TexasRed | 492 | 576 |
Alexa546 | 556 | 573 | Atto550 | 554 | 574 |
AlexaFlour532 | 530 | 555 | Atto647N | 644 | 667 |
Cy5 | 650 | 670 | Alexa647 | 650 | 668 |
Thiazol Orange | 510 | 530 | Dabcyl | 454 | |
JOE | 520 | 548 | BHQ-2 | 560-670 |
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