13C-葡萄糖和13C-谷氨酰胺對**細胞系中心碳代謝途徑的標記情況
胰腺**細胞系的代謝流分析。
用13C-葡萄糖和13C-谷氨酰胺對**細胞系中心碳代謝進行標記,通過分別追蹤U13C-葡萄糖或U13C-谷氨酰胺(平行實驗)來分析中心碳代謝過程中的13C標記情況。
圖1 用13C-葡萄糖和13C-谷氨酰胺對**細胞系中心碳代謝途徑的標記情況
除葡萄糖和谷氨酰胺外,還可以用任何參與目標代謝途徑、含重原子的分子標記細胞。例如,使用在酰胺位置標記的15N-谷氨酰胺或13C4-天冬氨酸。發現mTORC1通過嘧啶從頭合成途徑提高了細胞中N-氨甲酰天冬氨酸通量的水平。15N和13C標記的N-氨甲酰天冬氨酸以及尿苷一磷酸(UMP)驗證了這一點。圖3的數據表明,可以使用多個標記源來考察通過一條途徑的同位素異數體通量,以確定特定分子的碳或氮流來源。
嘧啶從頭合成途徑的同位素標記
還可以針對未標記和完全標記的目標代謝物(即所有重標記的碳原子或氮原子),以更全局的方式分析進入各種代謝物的穩定同位素通量。使用標記有13C6-葡萄糖的H929多發性骨髓瘤細胞并用阻斷代謝途徑的**進行處理,靶向分析了超過125個獨特的代謝物。
13C6-葡萄糖處理過的H929和RPMI 8226多發性骨髓瘤細胞、K562慢性髓性白血病細胞,分別暴露于代謝**劑2-脫氧葡萄糖(2-DG,糖酵解**劑),6-氨基煙酰胺(6-AN,磷酸戊糖途徑**劑)和化合物968(谷氨酰胺酶**劑)與隨行對照組(DMSO)的Ward聚類熱圖。
靶向LC-MS/MS數據中未標記(12C)代謝物和標記(13C)同位素的聚類
除了細胞的體外代謝流分析外,還通過靜脈注射10%(wt/vol)U-13C6-葡萄糖溶液標記小鼠來追蹤體內代謝,進行組織和**的體內同位素標記研究。此策略可用于確定對特定代謝途徑有貢獻的營養物質的分布,但它不能用于比較組織或動物之間的標記程度。
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