FAM-11-dUTP, 6-isomer

FAM-11-dUTP, 6-isomer 是一種熒光標(biāo)記的脫氧核苷三磷酸（dUTP）衍生物，常用于核酸標(biāo)記和分子生物學(xué)研究。該分子通過將熒光染料FAM（6-羧基熒光素，6-carboxyfluorescein）共價(jià)連接到脫氧尿苷三磷酸（dUTP）上，實(shí)現(xiàn)了在DNA合成過程中對(duì)新合成鏈的熒光標(biāo)記。

“11”代表FAM染料與dUTP之間通過一個(gè)11個(gè)原子的鏈（通常是碳鏈）作為連接臂，提供適當(dāng)?shù)目臻g距離以減少染料對(duì)酶反應(yīng)的干擾；“6-isomer”指的是FAM染料上的羧基位于分子的6號(hào)碳位置，與其7號(hào)碳位點(diǎn)異構(gòu)，6-異構(gòu)體是較為常用且光學(xué)性能優(yōu)良的異構(gòu)體。

化學(xué)結(jié)構(gòu)與性質(zhì)

FAM-11-dUTP由以下三部分組成：

脫氧尿苷三磷酸（dUTP）：DNA合成中可被DNA聚合酶摻入DNA鏈的核苷酸之一，堿基為尿嘧啶，結(jié)構(gòu)類似于dTTP。

FAM染料（6-carboxyfluorescein）：屬于熒光素類染料，具有熒光性能，激發(fā)波長(zhǎng)約為495 nm，發(fā)射波長(zhǎng)約為520 nm，發(fā)射綠色熒光，適用于多種熒光檢測(cè)平臺(tái)。

11-碳連接臂：將FAM染料與dUTP連接的空間橋梁，減少染料與酶的空間阻礙，提高摻入效率及標(biāo)記的穩(wěn)定性。

物理化學(xué)性質(zhì)

分子量：一般約在1000-1200 Da范圍，具體數(shù)值取決于連接臂的化學(xué)組成和標(biāo)記方式。

溶解性：良好的水溶性，適合在水性緩沖液中使用。

光學(xué)性質(zhì)：激發(fā)波長(zhǎng)約495 nm，發(fā)射波長(zhǎng)約520 nm，呈鮮明的綠色熒光。高量子產(chǎn)率和亮度使其成為分子生物學(xué)中常用的綠色熒光探針。

穩(wěn)定性：較為穩(wěn)定的熒光信號(hào)，能夠適應(yīng)多種實(shí)驗(yàn)條件。

應(yīng)用領(lǐng)域

熒光標(biāo)記DNA合成

FAM-11-dUTP可被DNA聚合酶摻入DNA合成過程中，直接在新合成的DNA鏈中標(biāo)記熒光，方便對(duì)DNA進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)和分析。

實(shí)時(shí)定量PCR（qPCR）

在qPCR實(shí)驗(yàn)中，F(xiàn)AM-11-dUTP可作為熒光核苷酸摻入模板擴(kuò)增產(chǎn)物，通過實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)綠色熒光信號(hào)，實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)DNA的定量檢測(cè)。

原位雜交（FISH）

FAM-11-dUTP摻入標(biāo)記的探針能夠在細(xì)胞或組織切片中定位特定核酸序列，方便熒光顯微鏡觀察基因表達(dá)或染色體異常。

分子檢測(cè)技術(shù)

包括DNA微陣列芯片、單分子熒光檢測(cè)以及核酸酶活性測(cè)定等，利用該熒光核苷酸的靈敏信號(hào)實(shí)現(xiàn)分子級(jí)別的檢測(cè)和定量。

相關(guān)推薦：

Azidoacetic acid NHS ester ，824426-32-6

3-Azidopropionic Acid ，18523-47-2

72320-38-8，3-Azidopropan-1-ol

BDP FL tetrazine ，1225194-70-6

BDP FL Maleimide ，773859-49-7

azido-PEG8-amine ，857891-82-8

3-azido-1-Propanamine 88192-19-2

Biotin-11-dUTP ，CAS：1221498-88-9

Biotin-PEG8-NHS