sulfo-Cyanine3 dUTP

sulfo-Cyanine3 dUTP 是一種帶有磺化（sulfo）修飾的熒光標(biāo)記核苷酸，具體為標(biāo)記在胸苷三磷酸（dUTP）上的Cyanine3染料衍生物。它是一種重要的生物化學(xué)試劑，廣泛應(yīng)用于分子生物學(xué)、基因組學(xué)及細(xì)胞生物學(xué)領(lǐng)域，用于核酸標(biāo)記、檢測和成像。

化學(xué)結(jié)構(gòu)與性質(zhì)

sulfo-Cyanine3 dUTP由三部分組成：

dUTP（脫氧尿苷三磷酸）：這是DNA合成過程中可被DNA聚合酶摻入DNA鏈中的脫氧核苷三磷酸的一個變體，結(jié)構(gòu)上類似于dTTP（脫氧胸苷三磷酸），但含有尿嘧啶堿基。

Cyanine3（Cy3）熒光染料：Cyanine染料家族的一員，Cy3以其明亮的橙紅色熒光和較高的光穩(wěn)定性而聞名，激發(fā)波長一般約為550 nm，發(fā)射波長約為570 nm，適合多種熒光檢測儀器和顯微鏡。

磺化修飾（sulfo-）：磺化基團(tuán)賦予Cyanine3染料水溶性增強(qiáng)的特性，減少非特異性結(jié)合，提高標(biāo)記反應(yīng)的特異性和效率。

物理化學(xué)性質(zhì)

分子量：約在1000-1200 Da范圍，具體根據(jù)修飾的具體化學(xué)結(jié)構(gòu)而略有不同。

溶解性：由于磺化基團(tuán)的存在，sulfo-Cyanine3 dUTP高度水溶性，易于溶解于緩沖液中，適合在生物反應(yīng)體系中使用。

激發(fā)/發(fā)射波長：激發(fā)波長約550 nm，發(fā)射波長約570 nm，屬于橙紅色熒光，便于多通道熒光顯微鏡和熒光檢測儀器的檢測。

穩(wěn)定性：磺化Cy3染料較普通Cy3更穩(wěn)定，不易發(fā)生光漂白，適合長時間的熒光成像。

應(yīng)用領(lǐng)域

DNA標(biāo)記和檢測

sulfo-Cyanine3 dUTP作為熒光核苷酸摻入DNA分子中，常用于原位雜交（FISH）、PCR擴(kuò)增、DNA合成及標(biāo)記實(shí)驗。利用DNA聚合酶的酶促反應(yīng)，將sulfo-Cyanine3 dUTP摻入合成的DNA鏈中，標(biāo)記的DNA可以直接被熒光檢測器檢測，提高檢測靈敏度和準(zhǔn)確性。

基因表達(dá)分析

在核酸雜交芯片技術(shù)中，帶有sulfo-Cyanine3標(biāo)記的核苷酸可以用于標(biāo)記cDNA探針，幫助檢測目標(biāo)mRNA的表達(dá)量，支持基因表達(dá)譜分析。

細(xì)胞成像

標(biāo)記后的核酸探針可以通過熒光顯微鏡進(jìn)行細(xì)胞內(nèi)核酸定位和動態(tài)觀察，幫助研究細(xì)胞內(nèi)基因表達(dá)和DNA復(fù)制過程。

熒光定量PCR (qPCR)

部分qPCR體系采用熒光標(biāo)記核苷酸替代部分天然dNTP，sulfo-Cyanine3 dUTP可以作為熒光信號來源，實(shí)現(xiàn)實(shí)時監(jiān)測DNA擴(kuò)增。

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